Dada la importancia de los signos de infección en Neonatología en todas sus etapas y la necesidad de criterios y consensos sobre sepsis en la Provincia, se realiza un estudio descriptivo transversal, con el objetivo de identificar los microorganismos aislados en muestras de recién nacidos con riesgo de infección, destacar algunos elementos clínicos de interés, así como la resistencia a los antimicrobianos, en la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales, del Hospital Ginecobstétrico Sur “Mariana Grajales Coello” de Santiago de Cuba, durante el período  septiembre 2012-agosto 2013 . En el Laboratorio de Microbiología se recibieron 519 estudios microbiológicos realizados a estos recién nacidos, obteniéndose 123 cepas de aislamientos microbianos. Los microorganismos más aislados fueron: La Klebsiella spp Pseudomona SPP, Estafilococo patógeno (coagulasa positivo) (seguido de Acinetobacter y de la Escherichia coli resultando la frecuencia de microorganismos gramnegativos identificados superior a los grampositivos. Las muestras más productivas en aislamientos fueron el Hemocultivo, tubo endotraqueal y catéter umbilical. Los Hemocultivos resultaron ser la muestra de oro en los estudios obtenidos y evidenciaron resultados indispensables en recién nacidos con diagnóstico de sepsis. Los antimicrobianos de amplio uso, mostraron patrones de elevada resistencia frente a los microorganismos identificados. Se realizan conclusiones y se emiten recomendaciones.